洪灾导致水环境严重污染，容易发生典型的流行病是疟疾、（霍乱）、伤寒。

肠道传染病

　　洪灾过后，由于气温高、水污染、苍蝇多，病原体繁殖快是急性肠道传染病高发的主要原因。例如甲型肝炎、戊型肝炎、伤寒与副伤寒、细菌性痢疾和其他感染性腹泻，其特点是通过“粪—口”途径传播，病人及无症状病原携带者是传染源。该病主要通过污染的水、食物或日常生活接触及苍蝇等传递病原微生物为主要传播方式。痢疾是洪灾后易发的一种肠道传染病，该病以腹部疼痛、里急后重、下赤白脓血便为主症，治疗时应使用的药物有：磺胺类药：磺胺药对痢疾杆菌有抗菌活性，但如与甲氧苄氨嘧啶（TMP）合用，则有协同效果。或者喹诺酮类：该类药物作用于细菌DNA促旋酶，具杀菌作用，无毒副作用，已成为成人菌痢的首选药。由于该类药可能影响儿童骨骼发育，学龄前儿童忌用。

　　灾后皮肤病

　　洪灾过后，为了自救家园，手足长时间浸泡在水中和长时间在水中作业，容易导致手足部位糜烂、脱屑，严重的可造成局部感染和溃疡。特别是双腿泡在温湿污浊的水中，双下肢皮肤容易受各种微生物的侵袭，时间一长可在皮肤上出现红斑、丘疹，渗出而导致湿疹。发生于阴囊及邻近部位的皮肤红斑，俗称烂裆，是长期奋战在抗洪第一线的抢险农民中较常见的。可以选用达可宁软膏和克霉唑霜外用，或者给予炉甘石洗剂及皮炎平霜。如果是轻度糜烂处用3％的硼酸粉湿敷，待干燥后外用激素或抗生素软膏涂擦即可。

　　虫媒传染病

　　登革热也是洪灾过后容易发作的虫媒传染病。该病是登革热病毒引起、伊蚊传播的一种急性传染病。临床特征为起病急骤，高热，全身肌肉、骨髓及关节痛，极度疲乏，部分患者可有皮疹、出血倾向和淋巴结肿大。可选用的药物有：中毒症状严重的患者，可短期使用小剂量肾上腺皮质激素，如口服强的松，对频繁呕吐、不能进食或有脱水、血容量不足的患者，应及时静脉输液。另外，流行性乙型脑炎也是洪灾过后易发传染病，主要是通过蚊子叮咬而传播乙脑病毒引起的急性传染病。患者主要表现发烧、剧烈头痛、恶心、呕吐、嗜睡不醒等症状，重者可出现抽搐、昏迷，甚至出现呼吸衰竭而死亡。可选用的药物有安宫牛黄丸以及病毒唑治疗，但是无特异性治疗方法。